Под гибкостью подразумевается скорость установки, переподключения новых или имеющихся систем хранения данных, без прерывания работы сети. Примером гибкости фабрики Fibre Channel, является простота подключения новой системы хранения данных и настройки зонинга, для осуществления доступа к ней серверов. Процесс подключения системы хранения данных не прерывает процессы вводавывода в сети.

Гибкость сети Fibre Channel, также позволяет осуществлять обновление прошивок в директорах, заменять и добавлять компоненты, не влияя на работу приложений и серверов.